João Seixas é Professor Associado e Agregado do Departamento de Física do Instituto Superior Técnico, com mais de 40 anos de experiência de investigador, quer teórico, quer experimental na Área de Física de Partículas e Física Nuclear. Está ligado ao Centro Europeu de Física de Partículas (CERN) desde 1983 onde, para além de ter sido Fellow e várias vezes Associate Researcher na Divisão Teórica e na Divisão Experimental, foi proponente da experiência NA60, que funcionou entre 2001 e 2004 no acelerador SPS e forneceu resultados fundamentais sobre matéria nuclear em condições extremas. Trabalhou também na Colaboração ALICE e é atualmente membro da Colaboração CMS do LHC onde foi responsável pelas medições de polarização de quarkonia pesados, que são uma referência mundial.
Está envolvido em computação e algoritmos quânticos aplicados à Física de Partículas e é o representante português no grupo de trabalho QC4HEP do CERN no contexto da iniciativa de tecnologias quânticas do CERN.

Trabalhou ainda em implementação de energias renováveis em meio urbano, onde fez estudos pioneiros em Portugal.
É Presidente do Centro de Física e Engenharia de Materiais Avançados (CeFEMA) e Diretor do Pólo de Lisboa do Laboratório Associado de Física de Materiais e Tecnologias Emergentes (LaPMET).
É Presidente da Associação Ópera na Academia e na Cidade e responsável pelo programa de concertos do Instituto Superior Técnico.

Tem vários prémios científicos, nomeadamente o Prémio da Sociedade Europeia de Física e o Prémio Breakthrough no contexto da Colaboração CMS, para além de vários prémios de excelência de ensino no IST.